EC運営代行おすすめ23選比較。費用相場と月商別の選び方

「受注処理や在庫管理に追われて本業に集中できない…」
「売上を伸ばしたいけど、マーケティングのノウハウがない…」

と悩んでいませんか？

そんな課題を解決するのが「ECサイト運営代行」です。プロの代行業者にECサイトの運営を任せることで、業務の効率化や売上向上が期待できます。

この記事では、ECサイト運営代行の業務内容・メリット・費用相場・選び方を徹底解説します。「どの業務を任せられるのか？」「費用はどれくらいかかるのか？」といった疑問を解決し、自社に最適な代行サービスを選べるようになります。

ECサイト運営を効率化し、売上をアップさせたい方はぜひ最後までご覧ください。

ECサイト運営代行とは

ECサイト運営代行とは、企業のEC事業における実務や戦略の一部または全体を、外部の専門業者が担うサービスです。単なる作業請負ではなく、販売戦略の設計、集客導線の最適化、CRMによるLTV最大化、モール戦略からD2Cブランド支援まで、その役割は多岐に渡ります。

近年のEC領域では「モール集客だけに依存できない」「広告運用が年々複雑化」「商品力だけでは売れない」「専門人材をフルスタックで揃えるのが非現実的」といった構造的変化が起きています。そのため、EC事業の成功可否は「どこまで内製し、どこをプロに委ねるか」の設計で大きく変わります。

EC運営代行とEC運用代行・ECコンサルの違い

「EC運営代行」を調べていると、「EC運用代行」「ECコンサルティング」「EC構築代行」といった似た言葉が並びます。呼称は事業者ごとに統一されていないため、言葉の印象だけで選ぶと「任せたつもりの業務が範囲外だった」というズレが起きやすくなります。

判断の軸になるのは名前ではなく、どこまでの責任範囲を持つのかです。まずは4つの呼称を、責任範囲で並べて整理します。

呼称	主な担当範囲	売上目標への責任	向いている状況
EC運営代行	戦略設計から日々のオペレーションまで包括	持つことが多い	社内のEC担当が1人以下。立ち上げから任せたい
EC運用代行	受注処理・在庫更新・ページ更新などの日次実務	持たないことが多い	戦略は自社にあり、手が足りていない
ECコンサルティング	分析・戦略立案・改善提案（助言が中心）	持たない	社内に実行できる人材がいる
EC構築代行	サイト・モール店舗の新規構築、リニューアル	持たない（構築完了が納品）	これから出店する。作り直したい

楽天市場の店舗で「作業の手」ではなく「戦略とノウハウ」を外部に求めたい場合は、楽天特化のコンサル会社が候補になります。楽天ECC・運営代行との違いは以下の記事で整理しています。

関連記事：楽天コンサルおすすめ17選比較。費用相場と失敗しない選び方

「運営」と「運用」は、実務が動く範囲が違う

一般に「運営代行」は売上をつくるところまでを引き受け、商品の選定・価格設計・広告投資の判断まで踏み込みます。一方の「運用代行」は、決まった方針にそって日々のオペレーションを回す役割が中心です。同じ月額でも、前者は「売上をどう伸ばすか」を一緒に考える相手、後者は「決めたことを確実に回す」相手になります。

自社の課題が「何をすべきか分からない」なら運営代行、「やることは決まっているが人手が足りない」なら運用代行が近くなります。ここを取り違えると、戦略提案を期待して運用代行に発注し、指示待ちの状態になってしまいます。

見積もりを取る前に、責任範囲を1枚に書き出す

複数社から見積もりを取る前に、任せたい業務と自社に残す業務を一覧にしておくと、各社の提案を同じ土俵で比較できます。この整理をしないまま相談すると、各社が得意な範囲だけを切り出した見積もりが並び、金額の高安しか見えなくなります。

とくに次の3点は、契約前に文書で確認しておくことをおすすめします。

• 売上目標の設定と達成責任は、どちらが持つか
• 広告費の運用判断は、どちらが決めるか
• 商品ページの最終公開権限は、どちらにあるか

ECサイト運営代行に依頼できる業務

ECサイト運営代行に依頼できる業務は、会社によって対応範囲が大きく異なります。まずは全体像を確認しましょう。

業務カテゴリ	代表業務内容	主な目的・成果
ECサイト運営実務	商品登録、在庫管理、CS対応、キャンペーン設定など	日々の運営業務を安定させ、ミス・機会損失を防止
マーケティング支援	広告運用、SNS企画、LINE・メルマガ施策など	新規獲得と再訪を強化し、売上を最大化
UI/UX改善	導線設計、LP改善、カート離脱率改善など	購入率の向上と離脱防止
CRM/LTV最大化	顧客分析、ステップ配信、ロイヤル化施策	継続率を高めLTVを最大化
システム・サイト構築	カート選定、アプリ開発、リプレイス支援など	拡張性と運用性を両立した構造構築
モール連携運用	Amazon、楽天、Yahoo!などの出店・運営支援	販路拡大とモール最適化運用
オムニチャネル支援	店舗連携、在庫一元化、体験統合支援	リアルとECの統合体験を設計
分析と改善提案	アクセス解析、CVR分析、PDCA設計	成果改善のための定量的支援と意思決定支援

制作だけを依頼して運用は自社で行う場合と、記事制作・運用改善まで含めて外注する場合では、総費用・必要な社内体制・成果が出るまでの期間がすべて変わります。「どこからどこまでを外注したいか」を事前に整理しておきましょう。

分析・改善に強みのあるECコンサル会社は「ECコンサル会社おすすめ15選を徹底比較！費用相場から選び方まで解説」で詳しく紹介しています。

ECサイト運営代行の費用相場

ECサイト運営代行の費用相場は、契約形態によって大きく異なります。

契約形態	費用相場	向いている企業
月額固定型	月10万〜100万円以上	定型業務を安定的に依頼したい企業
成果報酬型	売上の5〜15％程度	リスクを抑えつつ成果を重視したい企業
複合型（固定＋成果報酬）	月20万〜50万円＋売上の5〜10％	安定運用と成果連動のバランスを取りたい企業

初期費用は多くのケースで10万〜30万円程度発生します。EC運営代行の費用相場は「EC運営代行の費用相場を徹底解説！内訳や費用を抑えるポイントまで紹介」でも詳しく解説しています。

なお、メルカリShopsは初期費用・月額費用が無料で、売上の10%が販売手数料としてかかる仕組みです。そのため代行費用も「手数料10%＋代行費」で考える必要があり、他のモールとは有利な料金形態が変わります。メルカリShopsの場合の月商別のコスト試算は、以下の記事で解説しています。

関連記事：メルカリShops運用代行おすすめ12選比較。費用相場とタイプ別の選び方

月商別のリアルな外注パターンと実際の費用内訳

EC運営代行の費用は、単純な料金比較ではなく「月商に対するコスト配分」と「外注範囲」が重要です。ここでは実際の支援事例に基づき、月商ごとの典型的な外注パターンと費用感を紹介します。

なお、ここで紹介する運営代行の費用には、商品の保管・梱包・発送といった物流費は含まれていません。物流も外注する場合に月商に対してどれくらいかかるかは、月商別の物流費シミュレーションを載せた以下の記事で確認できます。

関連記事：EC物流代行おすすめ16選比較。費用相場と出荷規模・商材別の選び方

【ケース1】月商数百万円規模（株式会社スクロール３６０）

調理器具製造メーカー（楽天市場・Amazon・Yahoo!ショッピング＋自社EC）

【抱えていた課題】
EC事業のリソース不足により、十分な運営・販促活動ができていなかった。特にAmazonやYahoo!ショッピングでは社内運営が追いつかず、楽天市場への自社ショップ新規出店も手が回らない状況だった。

【外注内容】
Yahoo!ショッピングと楽天市場の運営業務全般（戦略立案、広告運用・分析、日々の更新、販促施策、競合調査、モール担当者とのやり取りなど）を包括的に依頼

【得られた効果】
・Yahoo!ショッピングのアクセス数が前年比約360%、売上約8倍に成長
・CPA（顧客獲得単価）20％削減 ・楽天市場の新規出店もスムーズに完了し、年末商戦に間に合わせて売上最大化
・社内は確認・承認作業に集中でき、リソース不足を完全解消

【費用内訳】
月額30万円

この事例では、EC運営におけるリソース不足という課題を、運営代行サービスの活用によって根本的に解決しています。単なるコンサルティングや部分的な業務委託ではなく、戦略立案から日々の運営・販促施策までをワンストップでプロに任せることで、社内は事業戦略や意思決定などコア業務に集中できる体制を実現しました。その結果、アクセス数や売上が劇的に伸びただけでなく、CPA削減などコスト面でも大きな効果が得られています。

また、運営代行会社の持つ豊富なノウハウやリソースを活用することで、社内で人材を育てるよりも短期間で成果を出せる点も大きなメリットです。自社で専門スタッフを採用・育成するよりもコスト効率が高く、急成長や新規出店など、スピードが求められる局面で特に有効な外注パターンと言えるでしょう。

【ケース2】月商1,000万円規模（株式会社いつも）

飲料メーカー（楽天市場＋自社EC）

【抱えていた課題】
・楽天市場における店舗運営のノウハウ不足
・EC事業の社内リソース不足

【外注内容】
・ページ改善・商品登録・メルマガ雛形作成・バナー制作など一部運営業務を委託
・広告運用

【得られた効果】
・楽天市場店の売上高が2年間で1.7倍に拡大
・RPP広告のROASが毎月500%以上を達成
・過去最高月商を複数回更新
・広告経由の売上が右肩上がりで成長

【費用内訳】
運営代行付コンサルティングプラン：20万〜40万円
RPP広告運用代行サービス：5万～10万円＋広告費実費

この事例からわかるように、月商数百万円規模でも運営代行と広告運用を組み合わせることで大きな成果を得ることが可能です。すべてを丸投げするのではなく、戦略設計や運用の一部を専門家に委託することで、社内のリソースを有効に活用しながら効率的に売上を伸ばせます。

また、費用対効果の高い広告運用やモール特有の施策を専門家から学びつつ実践できる点も大きなメリットです。費用は売上規模や委託範囲によって変動しますが、月額30万円から50万円程度が目安となります。

【ケース3】月商3,000万円規模（ECマインド株式会社）

アパレル（楽天市場）

【抱えていた課題】
社内リソースの確保が難しく、高い実務レベルやスピード感のある人材が必要だったこと、さらに売上アップにつながるノウハウを求めていたことが課題だった

【外注内容】
商品登録、商品情報の変更、サイト更新、イベント対応、広告運用など、楽天市場での運営業務全般を幅広く委託。月間の主な業務範囲を取り決め、固定費で契約し、業務範囲を超える場合はスポットで対応する形を採用

【得られた効果】
楽天運営に関する確かな知見とスピード感のある対応により、社内スタッフが異動しても運営の質が落ちることなく、安定したショップ運営が実現

【費用内訳】
月額30~40万円（追加業務が発生した場合は別途見積もりでスポット対応）

この事例では、年商4億円規模という比較的大きな事業規模であっても、運営代行を活用することで社内のリソース不足や人材確保の課題を解消しつつ、安定した運営と売上アップに必要なノウハウを得られています。

固定費契約により月々のコストが明確で、業務範囲を超える場合のみスポットで追加費用が発生するため、コストコントロールもしやすいのが特徴です。また、スタッフの異動など社内体制が変化しても運営の質を維持できるため、長期的な安定運営を目指す企業にとって非常に有効な外注パターンと言えるでしょう。

このように、月商規模が大きくなるほど、運営業務全般をプロに委託することで自社のリソースをコア業務に集中させ、安定した成長と持続的な売上アップを実現する企業が増えています。外注費用は月額30～40万円が目安となり、業務内容や追加対応によって柔軟に調整できる点も大きなメリットです。

ECサイト運営代行の本当に見るべき3つの比較ポイント

サービス内容や費用だけを比較するのは危険です。成果につながるパートナーを選ぶには、以下3点を見極めましょう。

• 売上を伸ばす導線設計の対応力
• 自社商品や業界への理解力
• コミュニケーション体制

売上を伸ばす動線設計の対応力

商品が良くても、ユーザーが迷わず購入できる導線がなければ売上は伸びません。優れた代行会社は、売上データやヒートマップ分析をもとに「売れる流れ」を設計できます。ユーザー属性別のLP設計、スマホ導線最適化、カート離脱を防ぐリマインド、商品詳細ページへのレビュー・FAQ配置など、「売上導線をどう作るか」を戦略的に考えられる会社こそ信頼できるパートナーです。

自社商品や業界への理解力

商品理解が浅いまま施策を打たれても的外れな結果になりがちです。とくにD2Cやニッチ市場では、競合や顧客心理の解像度が低いと「数字が出ないが原因が分からない」状況に陥ります。ターゲットの購入動機を把握できているか、商品のUSPを言語化できるか、業界特有の販売サイクルを理解しているかを、ヒアリング時に確認しましょう。

コミュニケーション体制

施策の質やスピードは「誰とどんな体制で進めるか」に大きく左右されます。「担当者がころころ変わる」「返信が遅い」「何をしているか不透明」といったズレは失敗のもとです。専任担当との定例MTG、チャットでの即時レスポンス、月次KPIレポートの共有、臨時対応のルール化など、対応の見える化が整っているかを確認しましょう。

ECサイト運営代行の選び方

EC運営代行は、得意なモールによって成果が大きく変わります。同じ「運営代行」でも、楽天市場のイベント設計に習熟した会社とAmazonのカタログ最適化に強い会社では、打ち手そのものが違うためです。ここでは主要な4つの領域に分類し、それぞれの特徴と向いている企業をご紹介します。

1. 楽天市場に強いタイプ ｜ イベント設計と店舗ページの作り込みで伸ばしたい場合
2. Amazonに強いタイプ ｜ カタログ最適化と広告の入札管理で伸ばしたい場合
3. Yahoo!ショッピングに強いタイプ ｜ 低コストとPayPay経済圏を活かしたい場合
4. D2C（自社EC）に強いタイプ ｜ 顧客データを自社に蓄積して伸ばしたい場合

まずは、以下の診断ツールで自社に合う委託範囲のタイプを確認してみてください。

1. 楽天市場に強いタイプ

楽天市場は、検索順位のロジックとイベント設計の両方を押さえないと売上が伸びません。スーパーSALEやお買い物マラソンといったイベントに合わせたクーポン・ポイント倍率の設計、RMSでの日々の設定変更、店舗ページの作り込みが成果を左右します。

このタイプの会社は、RMSの運用に習熟しており、イベントカレンダーを前提に逆算した施策の組み立てができます。楽天が用意する広告メニュー（RPP広告・クーポンアドバンス広告など）の配分判断や、ECコンサルタントとのやりとりを代行してくれる会社もあります。

このタイプへの依頼に向いている企業は以下になります。

• 売上の中心が楽天市場で、イベント対応に手が回っていない
• RMSの設定変更や広告調整を任せられる人が社内にいない
• 店舗ページのデザインから見直したい

このタイプの会社紹介へジャンプ ↓

楽天市場だけをさらに詳しく比較したい場合は、楽天運営代行おすすめ16選比較もあわせてご覧ください。

2. Amazonに強いタイプ

Amazonは商品カタログを複数の出品者が共有する構造のため、楽天とは対策の性質がまったく異なります。相乗り出品への対応、カートの獲得、スポンサープロダクト広告の入札管理、A+コンテンツの整備が主な打ち手になります。

このタイプの会社は、広告の入札とカタログ最適化を同時に回すことに慣れています。FBAを使った物流設計まで含めて相談できる会社もあり、在庫と広告のバランスを取りながら販売数を伸ばす設計が期待できます。

このタイプへの依頼に向いている企業は以下になります。

• Amazonでの相乗り出品や価格競争に悩んでいる
• スポンサープロダクト広告の費用対効果が読めていない
• FBAを含めた物流設計から相談したい

このタイプの会社紹介へジャンプ ↓

Amazonだけをさらに詳しく比較したい場合は、Amazon運用代行おすすめ21選比較とAmazon商品登録代行もあわせてご覧ください。

3. Yahoo!ショッピングに強いタイプ

Yahoo!ショッピングは出店コストが低い一方で、PayPayポイントを軸にした販促設計が売上に直結します。ストアクリエイターProでの日々の運用、アイテムマッチ広告の調整、5のつく日などのキャンペーンに合わせた在庫と価格の設計が必要です。

このタイプの会社は、楽天・Amazonと比べて情報が少ないYahoo!ショッピング特有の運用に慣れており、少ない広告費で露出を取る設計を組めます。公式パートナー認定を受けているかどうかで提供できる情報量が変わるため、認定状況を確認しておくとよいでしょう。

このタイプへの依頼に向いている企業は以下になります。

• Yahoo!ショッピングに出店したが施策が手つかずになっている
• PayPay経済圏の販促を活用しきれていない
• 楽天と併売しており、在庫と価格の管理が煩雑になっている

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Yahoo!ショッピングに絞って代行会社を比較したい方は、戦略コンサル・伴走型／運営まるごと代行型／広告・販促特化型／受注・物流一体型の4タイプに分けて17社を紹介している以下の記事をご覧ください。

関連記事：Yahoo!ショッピング運営代行おすすめ17選比較。料金改定後の費用相場とタイプ別の選び方

4. D2C（自社EC）に強いタイプ

自社ECはモールと違い、集客をゼロから作る必要があります。そのぶん顧客データを自社に蓄積でき、リピートとLTVを設計できるのが強みです。カートシステムの選定、広告からの新規獲得、CRMによる引き上げ、定期購入の設計が主な論点になります。

このタイプの会社は、広告運用とCRMの両方を見られる体制を持っていることが多く、新規獲得の単価とリピート率の両面から改善を進めます。SNSや自社メディアからの流入設計まで含めて相談できるかが、モール中心の会社との違いになります。

このタイプへの依頼に向いている企業は以下になります。

• モール依存から脱して自社ECを伸ばしたい
• 新規獲得の広告費が高止まりしている
• 定期購入やリピート施策を設計したい

このタイプの会社紹介へジャンプ ↓

カートがShopifyの場合はShopify運用代行、これから構築する場合はECサイト制作会社もあわせてご覧ください。

ECサイト運営代行会社23選一覧比較表

本記事で紹介するECサイト運営代行会社の一覧比較表です。

【楽天市場】の運用に強みを持つECサイト運営代行会社

初めに、楽天市場の運用に特化している代行会社を紹介します。

株式会社いつも

株式会社いつもは、楽天市場におけるEC運営代行の分野で豊富な実績と独自の強みを持つ企業です。楽天市場特有のアルゴリズムやプロモーション施策、ユーザー動線設計に精通しており、単なる運営業務の代行にとどまらず、売上を最大化するための戦略的な導線設計と実行力が際立っています。

特に、商品や業界ごとの市場特性を深く理解する力に長けており、クライアントごとに最適な販売戦略を立案できる点が大きな差別化ポイントです。

加えて、運用チームは各分野のスペシャリストで構成されており、商品企画からページ制作、広告運用、データ分析まで一貫したサポート体制を整えています。クライアントとのコミュニケーションも密に行い、迅速な対応とレポーティングを重視することで、信頼関係を築きながら柔軟かつ持続的な売上成長を実現しています。

導線設計の対応力	データ分析に基づいた戦略的な導線設計と施策実行で売上最大化を目指すことが可能
料金	要問い合わせ

NE株式会社

NE株式会社の最大の強みは、2,000店舗以上のコンサルティング実績に裏打ちされた豊富なノウハウと、業界No.1の受注管理システム「ネクストエンジン」を活用したデータドリブンな戦略提案にあります。単なる運営業務の代行にとどまらず、SEO対策や広告運用、商品ページ最適化、データ分析など、売上を伸ばすための導線設計や販促施策を一気通貫でサポートできる点が、他社と大きく異なるポイントです。

また、NE株式会社は多様な業種・商材への対応力が高く、楽天市場の特性やトレンドを踏まえた最適な運営を実現します。業界や自社商品の理解を深めたうえで、クライアントごとにカスタマイズした施策を提案できるため、汎用的な運用代行では得られない成果を期待できます。

さらに、専任コンサルタントによるきめ細やかなコミュニケーション体制を敷いており、ITリテラシーに自信がない企業や、初めて運営代行を利用する企業でも安心して任せられるサポート力が評価されています。

導線設計の対応力	多様な業種・商材への対応力が高く、特性やトレンドを踏まえた最適な運営が可能
料金	3,000円（基本料金）＋従量課金制

トゥルーコンサルティング株式会社

トゥルーコンサルティング株式会社の特徴は、EC分野で累計,3000社以上の支援実績を持ち、業界トップシェアに導いたノウハウと実践力にあります。特に楽天市場運用においては、売上を伸ばすための導線設計や、商品ページの最適化、広告運用、競合分析、ブランディングなど、売上アップに直結する多角的な施策をワンストップで提供しています。

他社との違いとして、トゥルーコンサルティングは「コンサルティング専業」である点が挙げられます。多くの運営代行会社がシステム販売や広告代理業も兼ねる中、同社はコンサルティングに特化しているため、クライアントの利益最大化に集中できる体制を構築しています。

また、EC運営の現場経験が豊富なプロフェッショナルが在籍し、クライアントごとの業界特性や商品特性を深く理解したうえで、オーダーメイドの戦略立案と実行支援を行う点も強みです。

導線設計の対応力	業界トップシェアに導いたノウハウを活かし、楽天市場を含む各モールで売上アップに直結する導線設計やページ最適化を実施
料金	要問い合わせ

株式会社Wacworks

株式会社Wacworksは、楽天市場をはじめとしたECモール運営において、売上アップに直結する導線設計や戦略立案、集客・サイト改善までを一気通貫で支援できる、実績と専門性を兼ね備えたEC運営代行会社です。

最大の特徴は、楽天市場のアルゴリズムや広告仕様を熟知したプロフェッショナルが多数在籍し、過去120店舗以上の支援実績や売上向上率233％超といった圧倒的な成果を出している点にあります。他社と異なり、実際に楽天市場で売上を伸ばした経験者のみをアサインし、イベントやセールなどにも迅速に複数名体制で対応できるため、スピード感と柔軟性を両立しています。

また、クライアントの事業や業界特性を深く理解した上で、勝ち筋から逆算したプランを提案し、ノウハウの蓄積も重視しているため、単なる作業代行にとどまらず、クライアントの成長パートナーとして長期的な成果創出を実現しています。

導線設計の対応力	楽天市場のアルゴリズムと広告仕様を熟知したプロが、売上向上率233％超の実績をもとに戦略から実行まで一気通貫で支援
料金	要問い合わせ

サヴァリ株式会社

サヴァリ株式会社は、楽天市場の公式コマースパートナーにも認定されており、モール仕様への深い知見を活かした導線設計や、競合他社との差別化施策の提案力が強みの会社です。

サヴァリには大手ECモールやネットショップ店長の実務経験者が在籍し、クライアントごとの業界特性や商品理解をもとに最適な戦略を立案。実際に新規ブランドの楽天出店で初月400万円、楽天スーパーSALEで800万円の売上達成など、具体的な成果事例も豊富です。広告運用やSEO、SNS・インフルエンサー施策、ライブコマースなど多様な集客手法を駆使し、流行や新規顧客層へのアプローチにも柔軟に対応可能です。

さらに、ディレクターやコンサルタントによる手厚いサポート体制と、クライアントとの密なコミュニケーションを重視している点もサヴァリならでは。部分的な業務代行にとどまらず、全体最適を見据えた一貫支援が可能なため、売上拡大や業務効率化を目指す企業にとって、他社と一線を画すパートナーとなっています。

導線設計の対応力	楽天市場公式パートナーとしてモール仕様に精通し、競合分析やページ最適化、広告・販促施策を組み合わせた多角的な導線設計で成果を創出
料金	要問い合わせ

ジャグー株式会社

ジャグー株式会社の特徴は、楽天出身者を中心としたEC経験豊富なプロフェッショナル集団が在籍し、戦略立案から実務まで一貫したサポートを提供している点です。単なるアドバイスや作業代行にとどまらず、各領域の専門家をアサインし、クライアントごとの商材や目標に合わせてオーダーメイドの支援を実施します。これにより、売上拡大につながる導線設計や最短最速の効果検証サイクルを実現し、「勝って当たり前」の状況を目指せる体制を構築しています。

また、「売上を上げるだけでは3流、自走できる状態にまでサポートできて1流」をモットーに掲げ、単なる売上向上だけでなく、クライアントが自走できるまでの実行支援に注力しています。業界や自社商品の理解にも長けており、楽天市場の標準ツールでは分析が難しい顧客のライフタイムバリューの可視化や、認知度の低いオリジナル商品の売上拡大など、他社にはないノウハウと実績を持っています。

コミュニケーション体制も充実しており、毎週のレポート共有や定例ミーティング、チャットを活用した密な連携によって、進捗や課題をリアルタイムで把握しながら柔軟に対応可能です。

導線設計の対応力	楽天出身者を中心としたプロ集団が、最短最速の効果検証サイクルとオーダーメイドの戦略設計で成果を創出
料金	要問い合わせ

【Amazon】の運用に強みを持つECサイト運営代行会社

次に、Amazonの運用に特化している代行会社を紹介します。

株式会社そばに

株式会社そばには、Amazonジャパン公認サービスプロバイダーとして認定されており、販売のプロフェッショナルと優秀なエンジニアによる強力な支援体制を構築しています。独自開発の商品データベースを活用した数千万件規模のデータ分析に基づき、クライアントごとに最適な販売戦略を提案できる点が他社と大きく異なります。

また、SEO対策やカスタマーサポート、広告運用、在庫管理、商品ページ作成などAmazon運用に必要な業務をワンストップで提供し、戦略立案から実行、効果測定まで一貫したサポートを提供しています。特に、クライアントの業界や自社商品の理解を深めた上で柔軟なカスタマイズ対応を行い、市場変化にも迅速に対応できる点が高く評価されています。

さらに、毎月のレポートや定期的なフィードバックを通じて、施策の振り返りと改善を徹底し、確実な売上向上を目指す実践的なコンサルティングを提供している点も他社との差別化ポイントです。

導線設計の対応力	独自データベースと豊富な実績に基づき、クライアントごとに最適な導線設計と戦略提案が可能
料金	初期費用：25,000円～ 128,000円～ / 月

しるし株式会社

しるし株式会社は、AmazonをはじめとするECモール運営において、売上最大化とブランド価値の両立を追求する運用代行のプロフェッショナル集団です。最大の特徴は、元Amazon社員や各分野の専門家が在籍し、ブランド戦略とデータ分析に基づいた運用を一気通貫で支援する点にあります。

Amazon Ads認定パートナーとして広告運用やSEO対策、商品ページ改善、転売対策、不正転売検知など、Amazon運営に不可欠な業務を高度な専門性でサポート。特許取得の転売検知システムや分析ダッシュボードを活用し、データ駆動型の最適化を徹底しています。また、ブランドの独自性や業界特性への深い理解をもとに、短期的な売上だけでなく中長期的なブランド成長まで見据えた運用戦略を提案できる点が、他社にはない大きな強みです。

他社と比較しても、ブランド価値経営とデータ分析の専門性、そして成果報酬型の料金体系による“本気の伴走力”が際立つEC運営代行会社と言えます。

導線設計の対応力	データ分析とブランド戦略に基づき、特許取得のシステムを活用した最適な導線設計と売上最大化支援
料金	要問い合わせ

Sales Doctor（株式会社ウェルボン）

Sales Doctorの特徴は、商品ページの最適化から広告運用、キーワード戦略、データ分析まで、Amazonで売上を伸ばすためのあらゆる施策をワンストップで提供できる点です。特に食品や美容などのカテゴリーで豊富な実績を持ち、クライアントの業界特性や商品特性を深く理解したうえで、最適な導線設計やプロモーション戦略を構築してくれます。

また、Sales DoctorはAmazon Adsベリファイドパートナーとして、Amazon公式の認定を受けているため、広告運用においても高い専門性と信頼性を誇ります。データ駆動型の分析力を活かし、競合との差別化や市場動向を的確に捉えた施策を展開できるのも他社にはない大きな強みです。

契約期間も3か月からと短めに設定されており、まずは小規模から試したい企業にも利用しやすい点が評価されています。このように、Amazon運用の現場で培った専門性と柔軟な対応力、そしてデータ分析力を組み合わせ、クライアントごとに最適化された戦略を実行できるのがSales Doctorの他社との明確な違いです。

導線設計の対応力	商品ページ最適化・広告運用・キーワード戦略・データ分析を総合的に実施し、売上最大化に直結する導線設計を実現
料金	初期費用：100,000円～ 100,000円～ / 月（＋売上の3〜7%）

株式会社ピュアフラット

株式会社ピュアフラットは、3,000店舗以上の支援実績を持ち、平均372%という高い売上アップ率を実現している点は、他社と比較しても際立った成果と言えます。ピュアフラットの特徴は、単なる運用代行にとどまらず、競合調査や広告戦略、サイト設計までを一気通貫でサポートできる点にあります。

クライアントごとに専任担当者を配置し、細やかなコミュニケーションと定期的な報告会を通じて、企業ごとの業界特性や自社商品の強みを深く理解した上で最適な施策を提案します。また、広告運用においても業界トップクラスのノウハウを有し、集客から利益率改善、リピート率向上まで幅広い領域で成果を出しているのが特徴です。

ピュアフラットは「結果」にこだわる姿勢と、豊富な実績、そしてクライアントごとに最適化された戦略提案力で、Amazon運用を本気で伸ばしたい企業にとって有力な選択肢となります。

導線設計の対応力	3,000店舗以上の実績と平均372%の売上アップ率を誇り、競合調査・広告戦略・サイト設計を一気通貫で対応し、短期間で成果を出せる
料金	要問い合わせ

株式会社サイバーレコード

株式会社サイバーレコードは、Amazonの運用代行において国内でいち早く法人として出店サポートおよび運営代行を開始したパイオニア企業です。特にAmazon日本支社との強固な連携を活かし、他社にはない特別プランや手厚いサポート体制を提供できる点が大きな強みです。

累計400社以上の支援実績を誇り、楽天市場やYahoo!ショッピングの正規パートナーでもあるため、複数モールを横断した運用ノウハウと最新情報の提供力に優れています。さらに、EC運営に必要なサービスやシステムをすべて自社開発しており、クライアントごとの課題や業界特性に合わせて柔軟にカスタマイズできる点も他社との差別化ポイントです。

単なる運用代行にとどまらず、コンサルティングやブランディング、ふるさと納税事業など幅広い領域でECを活用した事業成長をワンストップでサポートしています。

導線設計の対応力	Amazon日本支社との連携や自社開発システムにより、データに基づいた売上向上施策を柔軟に実行
料金	要問い合わせ

【Yahoo!ショッピング】の運用に強みを持つECサイト運営代行会社

次に、Yahoo!ショッピングの運用に特化している代行会社を紹介します。

イーラ株式会社

イーラ株式会社は、月商1億円超の店舗運営経験を持つ代表が設立し、現場で培ったノウハウを活かし、売上拡大を目指す企業に対して実践的かつ成果に直結する支援を提供しています。Yahoo!ショッピングの新規出店から既存店舗の改善、集客、販売、接客まで一貫してサポートし、SEO対策や広告運用、商品ページ制作など多岐にわたるサービスをワンストップで提供できる点が大きな強みです。

また、イーラ株式会社はYahoo!ショッピングの公式パートナー認定を受けており、モール特有の集客・販売ノウハウを熟知した専任スタッフが、クライアントごとの現状や業界特性を深く理解した上で最適な戦略を提案します。さらに、補助金活用などコスト面でのサポートも充実しているため、初期投資を抑えつつ高品質なEC運営を実現できるのも特徴です。

他社と比較した際のイーラ株式会社の大きな違いは、「実店舗運営で得たリアルな知見」と「Yahoo!ショッピングに特化した専門性」、そして「柔軟な対応力」にあります。部分的な作業依頼にも対応できるため、必要な業務だけを効率的にアウトソースしたい企業にも最適です。

導線設計の対応力	実店舗運営経験に基づく売れる導線設計とモールSEO、広告運用のノウハウで売上拡大を強力にサポート
料金	要問い合わせ

株式会社ファイブスプリングス

株式会社ファイブスプリングスは、単なる運営代行にとどまらず、売上アップを目的とした戦略的な導線設計や、現場目線での細やかなサポートが強みです。特にYahoo!ショッピングでは、仕様変更やトレンドの変化に迅速に対応し、質の高いPDCAを繰り返すことで、継続的な売上成長を実現しています。

また、アパレル・グルメ・美容健康・雑貨など多様なジャンルに対応してきた豊富な経験があり、新規出店から既存店舗の改善まで幅広く支援できる点も特徴です。

ファイブスプリングスには、楽天SOY受賞店舗やYahoo!年間MVP受賞店舗など、数々の成功事例を持つECのプロフェッショナルが多数在籍しており、クライアントごとに専任担当者を設けることで、密なコミュニケーションと柔軟な対応を実現しています。

導線設計の対応力	Yahoo!ショッピングの仕様やトレンド変化に即応し、質の高いPDCAで継続的な売上成長を実現
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株式会社ワンプルーフ

株式会社ワンプルーフは、売上や利益の最大化を目的としたコンサルティングから、競合・市場分析、販促・プロモーション施策の立案・実行、SEO対策、広告運用、商品ページ制作、受注・発送指示、カスタマーサポートまで、EC事業に必要な業務をワンストップで提供しています。

ワンプルーフの最大の特徴は、ECモールのシステム仕様や運用ノウハウに精通したスタッフが多数在籍し、20名以上の運営体制でクライアントごとの課題や目標に合わせた柔軟なカスタマイズ対応ができる点です。また、Yahoo!ショッピングを含む複数モール・自社ECサイトの多店舗展開や、アジア圏を中心とした越境ECにも対応しており、販路拡大を目指す事業者にも最適なパートナーです。

他社との違いとして、制作やマーケティング支援だけでなく、システム開発や1日7,000件を超える大量受注・顧客対応など、細部の業務まで一貫してサポートできる点が挙げられます。

導線設計の対応力	ECモール特有のシステムやユーザー動線を熟知し、商品や業界特性を踏まえた最適な導線設計・施策立案が可能
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株式会社YUGETA

株式会社YUGETAの特徴は、楽天市場で数百社以上のコンサルティング実績を持ち、同市場の約600人のコンサルタント中1位を3回獲得した代表を中心に、元楽天社員が多数在籍している点です。これにより、モール独自の構造やアルゴリズム、売上を伸ばすための導線設計に精通した専門家が、戦略立案から実務までを専任で担当します。

YUGETAは、商品ページやLP制作、広告運用、SEO、セール、SNS活用、クロスセル・アップセル施策など、売上を伸ばすためのあらゆる業務をワンストップで対応。特にYahoo!ショッピングや楽天市場での表彰実績が豊富で、約3,000万商品中2年連続年間1位を獲得するなど、他社にはない圧倒的な成果を生み出してきました。

また、コミュニケーション体制も、専任担当制を採用し、課題抽出から施策実行まで一貫してサポート。契約期間や料金体系も柔軟で、初期費用無料・単月契約・自由選択制と、事業フェーズや課題に合わせて無駄なく依頼できる点が、他社との大きな違いです。

導線設計の対応力	モール独自の構造やアルゴリズムを熟知した専門家が、戦略立案から実務までワンストップで対応
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有限会社ブレイントラスト

有限会社ブレイントラストは、「小さな会社のためのECサイトプロデュース」を掲げ、15年以上にわたるEC事業支援の実績と、2000店舗以上の制作・300店舗以上の運営ノウハウを活かし、店舗ごとの課題や予算に合わせた柔軟なサポートを提供しています。

特筆すべきは、初期費用・月額固定費ゼロの「完全成果報酬型」プランを展開している点で、売上がまだ立っていない店舗でも依頼しやすい料金体系を実現していることです。また、ヤフーコマースパートナー特別賞や楽天ビジネスグランプリなど、業界での受賞歴も豊富で、確かな実績と信頼性を兼ね備えています。

他社と比較した際の大きな違いは、単なる運営代行にとどまらず、商品ページ制作や広告運用、ブランディング、PRまでワンストップで対応できる総合力、そして「御社のEC部門のような立場」で深く入り込む伴走型支援です。特に小規模事業者やスタートアップにとっては、初期投資リスクを抑えつつ、プロのノウハウを活用して売上アップを目指せる点が大きな魅力となっています。

導線設計の対応力	15年以上・300店舗超の運営支援実績を活かし、店舗ごとの課題に応じた導線設計・売上アップ施策を提案
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株式会社アルド

株式会社アルドの強みは、Yahoo!ショッピングの売上の約8割を占めるサーチ経由での集客に着目し、独自開発の高速SEOツールやアイテムマッチ（キーワード広告）運用ノウハウを駆使して、短期間で売上アップを実現できる点にありますまた、単なる運用代行に留まらず、クライアントが自社運営に切り替えられるようノウハウを惜しみなく提供する体制も特徴的です。

Yahoo!ショッピング専門のため、業界や自社商品の特性を理解した上で、最適な導線設計や販促施策を提案できるほか、スマートフォン転換率向上など最新の販促手法も積極的に取り入れています。

さらに、代表自らが著書やセミナーを通じて情報発信を行い、実務経験とデータに基づいたアドバイスを提供できる点も他社との差別化ポイントです。定期的なオンラインミーティングやレポートを通じて、きめ細かなコミュニケーションとPDCAサイクルの徹底も評価されています。

導線設計の対応力	Yahoo!ショッピング特化のSEO・広告運用と独自ツールで短期間に売上アップを実現
料金	月額66,000円〜

【D2C】に強いECサイト運営代行会社

最後に、D2CのECに強い運営代行をご紹介します。

株式会社ザーナス

株式会社ザーナスは、スタッフ全員がネットショップ実務士や通販エキスパート、WEB解析士などの専門資格を有し、楽天市場などのネットショップ店長経験者で構成されているため、単なる作業代行にとどまらず、クライアントの事業や業界特性を深く理解した上で、売上拡大に直結する戦略的な運用提案が可能です。

ザーナス独自の「マインドフロー」などミクロ心理学を応用したアプローチにより、ユーザーの購買心理を的確に捉えた導線設計を実現。他社の画一的なサービスとは異なり、クライアントごとに最適な施策をカスタマイズし、93％のクライアントで売上向上を実現している実績があります。

また、業務範囲もECサイト構築から広告運用、受注・カスタマーサポート、物流業務まで幅広く対応し、D2Cモデルに求められる一貫した運用体制を提供できる点も大きな強みです。

導線設計の対応力	ミクロ心理学を応用した独自メソッドで、ユーザー心理を捉えた売上直結型の導線設計が強み
料金	107,800円～ / 月

Finner株式会社

Finner株式会社は、楽天出身の代表を中心に、楽天市場やAmazon、Qoo10、Yahoo!ショッピングなどの大手ECモールから自社ECサイトまで幅広いプラットフォームに対応し、出店・制作から運営代行、戦略立案、コンサルティングまで一貫してサポートできる体制を持っています。

特に、契約前に無料で店舗解析と定量分析を実施し、データに基づいた優先度の高い施策を抽出したうえで、業務範囲を柔軟にカスタマイズできる点が大きな強みです。これにより、無駄のない最適な運用設計が可能となり、サポート開始からわずか3ヶ月で売上3.5倍（月商300万→1,050万）を実現した事例や、支援先の平均成長率293％という高い実績を持っています。

また、FinnerはB2CマーケティングやCRMの専門家も在籍し、単なる作業代行や定型的なコンサルティングにとどまらず、消費者起点での施策提案や売上を伸ばすための導線設計に強みがあります。

導線設計の対応力	無料解析レポートとデータ分析に基づき、優先度の高い施策を抽出し、カスタマイズした導線設計で売上向上を実現
料金	コンサルティング：100,000円 / 月～ 運営代行：250,000円 / 月～

アートトレーディング株式会社

アートトレーディング株式会社は、クライアントごとに専属チームを編成し、商材や業界特性への深いヒアリングと現状・競合分析を徹底。これにより、一般的なテンプレート型ではなく、ブランドや商品の個性に最適化した導線設計や販促施策を実現しています。

また、Shopifyや楽天、Yahoo!ショッピングなど複数モール・カートへの豊富な対応実績を持ち、独自開発の物流管理システム「mylogi」により受注から発送までの業務効率化も図っています。D2Cブランドに不可欠な顧客体験の最適化やファン化を重視し、SNSやインフルエンサーマーケティング、ライブコマースなど新しい集客手法も積極的に提案が可能です。

さらに、Yahoo!・楽天の公式パートナーとしてバックエンド業務の品質にも定評があり、カスタマーサポートや物流まで一括で任せられる安心感があります。D2Cの成長フェーズに合わせて柔軟にサービスをカスタマイズできるため、売上向上とブランド価値の両立を本気で目指す企業にとって、アートトレーディングは最適なパートナーと言えるでしょう。

導線設計の対応力	専属チームによる徹底したヒアリングと現状・競合分析に基づき、ブランドや商材ごとに最適化した導線設計・販促施策を提案・実行
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株式会社arounds

株式会社aroundsは、D2C領域におけるEC運営代行の分野で、500社以上の支援実績と15年以上のノウハウを持つ専門企業です。単なる運営代行にとどまらず、ブランド価値を高めるコンテンツ制作や、売上を伸ばすための戦略立案・実行・効果検証までを一貫して自社内で完結できる体制が大きな強みです。

専属ディレクターが各分野のプロフェッショナルと連携し、クライアントごとに最適な施策をスピーディかつ高品質に提供します。また、楽天・Amazon・Yahoo!ショッピングなど主要モールから自社ECサイトまで幅広く対応し、業界や商材ごとの特性を深く理解した運用が可能です。

さらに、競合他社と比べて、長期的なブランド戦略と持続的な売上成長を重視し、クライアントの経営スタイルや課題に合わせた柔軟なプラン設計ができる点、そして運営継続率が90％を超える高い顧客満足度が際立っています。

導線設計の対応力	分析・戦略立案から実装・改善・効果検証まで一貫して対応し、売上拡大に直結する導線設計を実現
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株式会社ブランジスタソリューション

株式会社ブランジスタソリューションは、D2CブランドやメーカーのEC運営において、売上拡大を目指す企業に最適なEC運営代行サービスを提供しています。

他社と比較して際立つのは、400社・1,000サイト以上の豊富な運営実績に裏打ちされた、各モールや商材ごとのノウハウと、売上を伸ばすための導線設計力です。単なる作業請負ではなく、専任のWebディレクターが現状分析から施策提案までをリードし、企業ごとに最適な運営体制を構築。商品や業界特性への理解も深く、コスメやトラベル用品、食品など多様なD2C商材で成果を上げてきた実績があります。

また、クライアントとの密なコミュニケーション体制も特徴で、定期的な報告やスケジュール管理、数値分析を通じて、パートナーとして伴走するスタイルを徹底しています。売上向上に直結する集客・販促から、バックヤード業務まで一括対応できるため、人的リソースやノウハウ不足で悩むD2C企業の成長を力強く後押しします。

導線設計の対応力	モール・自社ECそれぞれに最適化した導線設計と豊富な成功事例、専任ディレクターによる施策提案力
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株式会社Hide&Seek

株式会社Hide&Seekは、単なるECサイトの運用代行にとどまらず、Amazon・楽天市場・Yahoo!ショッピングなど主要モールのマーケティングや運用、さらには自社ECの立ち上げからCRM戦略、Webマーケティングまでをワンストップで提供できる体制を構築しています。これまで10社以上の新規通販立ち上げ支援や既存事業のコンサルティング実績があり、支援先の中には月商5億円規模に成長した事例も存在します。

Hide&Seekの特徴は、業界歴15年以上の経験と知見を活かし、D2Cに特化したフルカバレッジのサポートを実現している点です。商品開発や市場調査、LP制作、広告運用、CRM施策まで、D2C事業の全工程を一貫して支援できるため、クライアントの多様な課題に柔軟に対応可能です。

また、クライアントに寄り添う姿勢を徹底しており、「一番の相談役」として信頼関係の構築を重視。実際にこれまでの支援先で解約がゼロという高い満足度を誇ります。

導線設計の対応力	Amazon・楽天・Yahoo!等のモール運用やWebマーケティング、モール内SEO・広告運用まで一貫して対応し、売上最大化の仕組みを構築
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ECサイト運営代行に関するよくある質問

EC運営代行を検討する際に多くの担当者が抱く疑問をまとめました。

Q. EC運営代行とは何ですか？

企業のEC事業の実務や戦略の一部・全体を外部の専門業者が担うサービスです。商品登録・在庫管理・受注・CSといった運営実務から、広告運用・SEO・CRM・サイト改善・物流まで幅広く対応します。「作業の外注」から「売上を伸ばす戦略パートナー」まで、依頼範囲は会社によって異なります。

Q. EC運用代行とは何ですか？EC運営代行とどう違いますか？

EC運用代行は、受注処理・在庫更新・ページ更新といった日々のオペレーションを担う役割が中心で、売上目標への責任は持たないことが一般的です。対してEC運営代行は、戦略設計から実務までを包括し、売上をつくるところまで引き受ける契約が多くなります。呼称は事業者ごとに統一されていないため、名前ではなく責任範囲で確認してください。詳しくは「EC運営代行とEC運用代行・ECコンサルの違い」で解説しています。

Q. ECサイト運営代行の費用相場はいくらですか？

契約形態によって異なり、月額固定型で月10万〜100万円以上、成果報酬型で売上の5〜15%、複合型で月20万〜50万円＋売上の5〜10%が目安です。初期費用は10万〜30万円程度が一般的です。月商規模や外注範囲によって大きく変わるため、複数社に見積もりを取るのがおすすめです。

Q. EC運営代行はどこがいいですか？

「どのチャネルで売るか」で選ぶのが基本です。楽天なら楽天特化（いつも・トゥルーコンサル等）、Amazonなら公認・認定パートナー（そばに・しるし・Sales Doctor等）、Yahoo!ならYahoo!専門（イーラ・アルド等）、自社ECならD2C特化（ザーナス・arounds等）が候補です。自社の主力チャネルと課題に合った会社を選びましょう。

Q. 個人事業主や小規模でも運営代行を頼めますか？

頼めます。完全成果報酬型（ブレイントラスト等）や、初期費用無料・単月契約（YUGETA等）、月額数万円台から対応する会社もあります。まずは一部業務（ページ制作・広告運用など）だけを切り出して依頼し、成果を見ながら範囲を広げるのが現実的です。

Q. 費用を抑えるにはどうすればいいですか？

「すべて丸投げ」ではなく、自社でできる業務と外注する業務を切り分けることが有効です。事例でも、戦略設計や運用の一部だけを委託して社内リソースを活かし、効率的に売上を伸ばしています。成果報酬型や必要な業務だけを選べる料金体系の会社を選ぶのもコスト最適化につながります。

外注範囲を絞る手段として、受注・在庫まわりをシステムで自動化する方法もあります。
自社でどこまで巻き取れるかを知りたい方は、以下の記事も参考にしてください。

関連記事：EC一元管理システム17選比較。タイプ別の選び方と料金相場を解説

Q. 運営代行と構築代行・ECコンサルは何が違いますか？

構築代行はサイトの制作・立ち上げが中心、ECコンサルは戦略助言が中心、運営代行は日々の運営実務＋改善まで実行するのが違いです。多くの運営代行会社は構築やコンサルも兼ねるため、「どこまで実行まで任せたいか」で選ぶとよいでしょう。分析・戦略に比重を置くならECコンサル会社も検討候補です。

まとめ

EC運営代行サービスは、専門的なノウハウやリソースを活用してEC事業の成長を加速させる有効な選択肢です。自社で対応しきれない業務や、より高い成果を求める領域をプロに任せることで、効率的な運営と売上拡大が期待できます。

特にモール型とD2C型では必要なスキルが異なるため、自社の販売チャネルや課題に最適な代行会社を選ぶことが重要です。その際は以下を重視しましょう。

• 売上を伸ばすための導線設計力
• 商品・業界への理解
• 円滑なコミュニケーション体制

費用や契約形態も事前にしっかり確認し、自社の強みや課題を明確にして必要な部分だけを外注することで、効率的かつ持続的なEC事業の成長を実現できます。

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関連記事：越境EC運営代行おすすめ18選比較。国別戦略に強い企業を見極めるポイントまで紹介
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